Το ΤΕΚΑ διοικείται από επταμελές Διοικητικό Συμβούλιο, το οποίο απαρτίζεται από υψηλού κύρους καταρτισμένα και εξειδικευμένα μέλη. Τα μέλη επιλέγονται με απόλυτη διαφάνεια και αξιοκρατία μέσα από μια ανοιχτή διαδικασία επιλογής που περιγράφεται αναλυτικά στο άρθρο 12 του Ν. 4826/2021.
Το ΔΣ θέτει τις κατευθυντήριες γραμμές της επενδυτικής πολιτικής του Ταμείου και καθορίζει τα βασικά χαρακτηριστικά των επενδυτικών προγραμμάτων.
Μέχρι να ολοκληρωθεί η διαδικασία συγκρότησης του πρώτου ΔΣ, και για διάστημα που δεν υπερβαίνει τους δώδεκα (12) μήνες από την ψήφιση του νόμου, το Ταμείο διοικείται από επταμελή Προσωρινή Διοικούσα Επιτροπή, η οποία συστάθηκε με υπουργική απόφαση ως μεταβατικό όργανο διοίκησής του, ώστε να διασφαλιστεί η εκκίνηση και η εύρυθμη λειτουργία του κατά το πρώτο διάστημα.
Η ΠΔΕ προβαίνει στις απαιτούμενες προπαρασκευαστικές ενέργειες για την ανάδειξη του πρώτου ΔΣ και την πρόσληψη του πρώτου Διευθύνοντος Συμβούλου, ενώ παράλληλα συντάσσει προσχέδια του Οργανισμού και των αναγκαίων για τη λειτουργία του Ταμείου Κανονισμών.